Es konnte auch vorkommen, dass sich das Fenster plötzlich nicht mehr öffnen oder schließen ließ. In einigen Fällen ist das Fenster sogar nach unten durchgefallen. Es hatte sich die Fensterhebemechanik verklemmt oder eines der Kunststoffteile ist zerbrochen. Dadurch war die Mechanik blockiert. Zur Abhilfe gab es hier einen Reparatursatz mit der Ersatzteilnummer 1JE 898 100 bzw. 1JE 898 099. Mit diesem Reparatursatz war es nicht nötig, den kompletten Aggregatträger zu tauschen. Bei dem Reparatursatz besteht das anfällige Teil jetzt aus Metall. VW hatte im Dezember 2003 dazu eine Kulanzregelung eingeführt. Bei einem Wagen, der zwischen 1 und 3 Jahre alt warm betrug die Kulanz 100 %. Autos mit einem Alter von 4 und 5 Jahren bekamen immerhin noch 50 %. Es war keinerlei Inspektionsnachweis erforderlich. 

Beim TDI kam es gelegentlich vor, dass der Wagen insgesamt eine schlechte Heizleistung hatte. Leider ist dies kein Mangel, sondern eine Tatsache, die man für den geringen Verbrauch durch den TDI in Kauf nehmen musste. Hier steht die Heizleistung in direktem Zusammenhang mit dem Verbrauch und den Außentemperaturen. Je kälter es draußen ist und je sparsamer der Wagen fährt, umso schlechter ist die Heizleistung. Wem die Heizleistung nicht ausreicht, der sollte sich überlegen, ob er sich eine Sitzheizung anschafft oder den Wagen mit einer Standheizung vorheizt.

Einige Fahrer berichteten, dass die Räder beim Radwechsel sehr fest sitzen. Die Felgen an den Hínterachsen haben sich durch Korrosion sehr schnell festgesetzt, sodass man die Räder beim Wechsel nur durch feste Schläge auf die Reifen lösen konnte. Vorbeugen kann man hier nur, wenn man den Rost regelmäßig entfernt und die Nabe mit Kupferpaste einstreicht.

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